ŽIV-1 pasaulinė ir regioninė molekulinė epidemiologija 1990–2024 m.: sisteminė apžvalga, pasaulinis tyrimas ir paplitimo analizė

Įvadas

Neseniai žurnale „Statyba ir statistika“ paskelbtame tyrime„Lancet“ infekcinės ligos(2026 m.) pateikia išsamiausią iki šiol atliktą pasaulinę ŽIV-1 molekulinės epidemiologijos analizę, kurioje integruojami sisteminės apžvalgos duomenys ir pasaulinė molekulinės stebėsenos apklausa.

Sujungus anksčiau prieinamus duomenų rinkinius (1990–2021 m.) su naujai surinktais sekos duomenimis, tyrime buvo įtraukta daugiau nei1,39 mln. ŽIV-1 genotipų nustatymo įrašų iš 154 šalių, surinktų nuo 1990 iki 2024 m.Naudodami UNAIDS įvertintą ŽIV infekuotų žmonių skaičių kaip svertinius koeficientus, tyrėjai sukūrė pasaulinius ir regioninius žemėlapius, apibūdinančius ŽIV-1 potipių, cirkuliuojančių rekombinantinių formų (CRF) ir unikalių rekombinantinių formų (URF) pasiskirstymą laike ir geografiniu požiūriu.

Išvados rodo, kad nors pasaulinė ŽIV-1 potipių situacija per pastaruosius du dešimtmečius išliko gana stabili, vyksta dideli regioniniai pokyčiai, ypač dėl didėjančios rekombinantinių formų įvairovės ir plitimo.

Studijų aplinkybės

Žmogaus imunodeficito 1 tipo virusas (ŽIV-1) pasižymi didele genetine įvairove dėl didelio mutacijų dažnio, rekombinacijos gebėjimo ir ilgalaikės perdavimo dinamikos.

Šis genetinis kintamumas turi svarbių pasekmių:

• · molekulinė stebėsena,
• · diagnostinio efektyvumo vertinimas,
• · antiretrovirusinių vaistų atsparumo stebėsena,
• · ir vakcinų kūrimo strategijos.

Tyrimo tikslas buvo apibūdinti ŽIV-1 potipių ir rekombinantinių formų pasaulinius ir regioninius pasiskirstymo modelius iš1990–2024 m., pateikiant atnaujintą molekulinę epidemiologinę sistemą, skirtą pasaulinei ŽIV prevencijai ir kontrolei.

Studijų planas ir metodai

Tyrėjai atliko sisteminę „PubMed“, „Embase“, „Global Health“ ir „CINAHL“ duomenų bazių apžvalgą, apimančią tyrimus, paskelbtus nuo 2022 m. sausio 1 d. iki 2025 m. sausio 22 d.

Be to, duomenys buvo renkami per Pasaulinį ŽIV molekulinės epidemiologijos bendradarbiavimo tinklą.

Tinkami duomenų rinkiniai:

• · ŽIV-1 molekulinio potipio informacija,
• · aiškiai apibrėžtos mėginių ėmimo vietos,
• · surinkimo datos,
• · ir pakankamą mėginių skaičių.

Galutiniame duomenų rinkinyje buvo:

• · 1 395 222 ŽIV-1 genotipų nustatymo įrašai 
• · 154 šalys 
• · šeši epidemiologiniai laikotarpiai:1990–1999, 2000–2004, 2005–2009, 2010–2014, 2015–2019, 2020–2024.

ŽIV-1 genetinių formų paplitimas pasaulyje ir regione buvo įvertintas naudojant UNAIDS pakoreguotus svertinius metodus.

ŽIV-1 potipių pasiskirstymas pasaulyje: C potipis išlieka dominuojantis

Per2020–2024 m.C potipis išliko vyraujančia ŽIV-1 linija visame pasaulyje, dėl kurios:

Apskritai rekombinantinės formos (įskaitant CRF ir URF) sudarė maždaug22,4 % visų ŽIV-1 infekcijų pasaulyje, pabrėžiant didėjantį ŽIV-1 genetinės įvairovės sudėtingumą.

C potipis ir toliau dominuoja daugiausia:

• · Pietų Afrika,
• · Pietų Azija,
• · ir keliose Rytų Afrikos šalyse.

Kadangi šiuose regionuose yra didelė pasaulinės ŽIV naštos dalis, C potipio dominavimas daro didelę įtaką pasauliniam paplitimo modeliui.

Regioniniai skirtumai: skirtingi evoliucijos modeliai skirtinguose žemynuose

Nors pasaulinė ŽIV-1 struktūra atrodo gana stabili, regioniniai modeliai iš esmės keičiasi.

Pietų Afrika ir Pietų Azija: nuolatinis C potipio dominavimas

Pietų Afrikai ir Pietų Azijai vis dar būdinga C potipio cirkuliacija.

Šiuose didelės naštos regionuose C potipis sudaro didžiąją daugumą cirkuliuojančių virusų, todėl jis yra pagrindinis C potipio paplitimo pasaulyje veiksnys.

Tačiau tyrime taip pat pabrėžiama, kad molekulinių mėginių ėmimo aprėptis kai kuriuose didelės virusinės naštos regionuose išlieka ribota, o tai rodo, kad norint geriau užfiksuoti vietinę virusinę įvairovę, reikia papildomų stebėjimo pastangų.

Šiaurės Amerika ir Lotynų Amerika: tęsiamas B potipio dominavimas

B potipis išlieka pagrindine cirkuliuojančia linija:

• · Šiaurės Amerika,
• · Lotynų Amerika.

Šie regionai pasižymi santykinai stabiliais molekuliniais epidemiologiniais modeliais, palyginti su regionais, kuriuose potipių perėjimai vyksta sparčiau.

Vakarų ir Vidurio Europa: didėjanti genetinė įvairovė

Vakarų ir Centrinė Europa išgyvena laipsnišką perėjimą nuo daugiausia B potipio epidemijos prie įvairesnio virusinio kraštovaizdžio.

Pagrindinės tendencijos apima:

• · mažėjanti B potipio dalis,
• · didėjantis rekombinantinių formų indėlis,
• · didėjantis ne B linijų skaičius.

Šie pokyčiai rodo, kad ŽIV-1 molekulinė įvairovė tampa vis svarbesnė net ir istoriškai B potipio dominuojančiuose regionuose.

Rytų Azija: spartus rekombinantinių formų plitimas

Rytų Azijoje užfiksuotas vienas reikšmingiausių epidemiologinių pokyčių.

Tyrime nustatyta, kad:

• · CRF07_BC kiekis laikui bėgant gerokai padidėjo,
• · B potipis ženkliai sumažėjo.

CRF07_BC padidėjo nuo maždaug13,1 % 2000–2004 m. laikotarpiu iki 48,1 % 2020–2024 m., rodantis didelį regioninės ŽIV-1 molekulinės epidemiologijos pokytį.

Ši transformacija pabrėžia nuolatinės molekulinės stebėsenos svarbą regionuose, kuriuose dominuoja rekombinantinės formos.

Rekombinantinės formos: auganti pasaulinės ŽIV-1 įvairovės sudedamoji dalis

Rekombinantinių formų dalis visame pasaulyje per pastaruosius dešimtmečius išaugo:

• · 2000–2004 m.: maždaug 20,8 %
• · 2010–2014 m.: maždaug 24,2 %
• · 2020–2024 m.: maždaug 22,4 %

Nors pasaulinė dalis pastaraisiais metais šiek tiek sumažėjo, rekombinantinės formos toliau plinta keliuose regionuose, ypač:

• · Rytų Azija,
• · Vakarų ir Vidurio Europa.

Tyrimas rodo, kad rekombinantinės formos kai kuriais atvejais vis dar gali būti nepakankamai įvertintos, nes daugelis stebėjimo programų daugiausia remiasi daliniais genomo regionais, kurie gali nevisiškai nustatyti sudėtingus rekombinacijos modelius.

Todėl bus svarbu stiprinti genomo stebėjimo metodus, ypač regionuose, kuriuose didelė ŽIV perdavimo našta ir didėja virusų įvairovė.

Visuomenės sveikata ir klinikinė reikšmė

1. Diagnostinėms sistemoms reikalingas nuolatinis skirtingų potipių vertinimas

Didėjanti ŽIV-1 genetinė įvairovė pabrėžia nuolatinio diagnostinių technologijų vertinimo svarbą įvairiose virusinėse aplinkose.

Nors dabartinės ŽIV diagnostikos ir virusinės apkrovos tyrimų platformos parodė platų pritaikomumą, nuolatinis patvirtinimas, susijęs su naujais potipiais ir rekombinantinėmis formomis, išlieka labai svarbus.

Būsima stebėsena turėtų apimti:

• · molekulinė epidemiologija,
• · diagnostinio našumo stebėjimas,
• · ir virusų evoliucijos analizė.

2. Atsparumo vaistams stebėsenai reikalinga platesnė genetinė aprėptis

Įvairių ŽIV-1 linijų plitimas gali turėti įtakos su atsparumu susijusių mutacijų atsiradimui, aptikimui ir interpretavimui.

Kai kurie tyrimai rodo, kad specifinės ŽIV-1 linijos, įskaitant su A6/A1 susijusius variantus, gali būti susijusios su padidėjusia virologinio nesėkmės rizika taikant tam tikras ilgalaikio veikimo kabotegraviro/rilpivirino gydymo aplinkybes.

Tačiau pasipriešinimo rezultatus lemia daug veiksnių, įskaitant:

• · pradinės atsparumo mutacijos,
• · gydymo istorija,
• · laikymasis,
• · ir virusinis genetinis fonas.

Todėl atsparumo stebėjimas atsižvelgiant į potipius išlieka vis svarbesnis.

3. Kuriant vakciną būtina atsižvelgti į regioninę virusinę įvairovę

Didelė ŽIV-1 genetinė įvairovė išlieka vienu iš pagrindinių vakcinos kūrimo iššūkių.

Kintantis potipių ir rekombinantinių formų pasiskirstymas pabrėžia vakcinavimo strategijų, kuriose būtų atsižvelgta į:

• · regioninėse cirkuliuojančiose padermėse,
• · virusų evoliucijos tendencijos,
• · ir platesnė imuninė aprėptis.

Pasauliniu mastu vienodas požiūris gali ne iki galo išspręsti visame pasaulyje cirkuliuojančio ŽIV-1 įvairovės problemą.

Išvada

Ši svarbi pasaulinė ŽIV-1 molekulinės epidemiologijos analizė rodo, kad pasaulinei virusinei aplinkai būdingas ir tęstinumas, ir pokyčiai.

Nors C potipis ir toliau sudaro beveik pusę pasaulinių ŽIV-1 infekcijų, regioniniai molekuliniai modeliai sparčiai kinta, o rekombinantinės formos vis labiau formuoja epidemijas tokiose srityse kaip Rytų Azija ir Europa.

Šie rezultatai patvirtina ilgalaikės molekulinės stebėsenos, skirtingų potipių diagnostikos patvirtinimo ir integruotų genomikos metodų svarbą siekiant paremti veiksmingą ŽIV prevenciją, gydymo stebėseną ir būsimą vakcinų kūrimą.

Nuoroda

1. ŽIV-1 pasaulinė ir regioninė molekulinė epidemiologija 1990–2024 m.: sisteminė apžvalga, pasaulinis tyrimas ir paplitimo analizė. „Lancet“ infekcinės ligos, 2026 m.