NeseniaiKinijos CDC savaitraštis2025 m. spalio mėn. bendrovė paskelbė svarbų mokslinį straipsnį, kuriame aprašomas epidemiologinis ir etiologinis ūminio gastroenterito protrūkio, kurį sukėlė C grupės rotavirusas (RVC), tyrimas Ludžou miesto, Sičuano provincijos, pradinėje mokykloje. Pažymėtina, kad tyrime lemiamą vaidmenį atliko „Macro & Micro-Test“ didelio našumo tikslinio patogeno gaudymo rinkinys (zondo gaudymas) ir viso genomo praturtinimo sekoskaitos technologija. Ši technologija, įgalinanti tiksliai identifikuoti patogenus ir atlikti išsamų genomo apibūdinimą, pateikė svarbių mokslinių įrodymų, leidžiančių greitai patvirtinti protrūkį, tiksliai atsekti šaltinį ir veiksmingai kontroliuoti protrūkį.
Staigus protrūkis: pirmasis praneštas RVC protrūkis Pietvakarių Kinijoje
2025 m. spalio 15 d. Ludžou pradinėje mokykloje kilo ūminio gastroenterito protrūkis. Mokykloje iš viso mokėsi 1943 mokiniai ir darbuotojai, pranešta apie 32 atvejus, įskaitant 6 laboratoriškai patvirtintus ir 26 kliniškai diagnozuotus atvejus, todėl bendras priepuolių dažnis siekė 1,65 %. Protrūkio pikas buvo spalio 15–16 d., o didžiausias priepuolių dažnis buvo 7 klasės 5 klasėje (23,08 %). Dauguma pacientų buvo mokyklinio amžiaus vaikai (vidutinis amžius: 10 metų), kuriems dažniausiai pasireiškė vėmimas (65,62 %), viduriavimas (46,87 %) ir pilvo skausmas (37,50 %). Simptomai paprastai truko 1–3 dienas, ir visi pacientai pasveiko be sunkių komplikacijų.
Epidemiologinio tyrimo metu nustatytas pirmas užsikrėtimo atvejis – 11 metų berniukas, mokantis 7-oje, 5 klasėje. Jo jaunesnioji sesuo anksčiau sirgo panašiais simptomais, o tai rodo, kad pirminis viruso perdavimas įvyko namuose. Nepakankamas vėmimo valdymas mokyklos teritorijoje, įskaitant tiesioginį šlavimą ir šalinimą be savalaikio dezinfekavimo ar zonos izoliavimo, kartu su prasta mokinių rankų higiena greičiausiai palengvino tolesnį viruso perdavimą. Dauguma paveiktų klasių buvo tarp antro ir penkto aukštų ir turėjo greta esančius vyrų tualetus, o tai rodo, kad prie viruso plitimo galėjo prisidėti tiek aerozolinis, tiek kontaktinis perdavimas.
Tyrimas tapo ypač sudėtingas, nes įprastiniai patogenų tyrimai, įskaitant noroviruso ir A grupės rotaviruso tyrimus, davė neigiamus rezultatus, rodančius, kad atsakingas buvo retas patogenas.
Etiologinė diagnozė: viso genomo sekvenavimas naudojant makro ir mikro testą nustato kaltininką
Pradinis noroviruso tyrimas buvo neigiamas. Vėliau Ludžou Ligų kontrolės ir prevencijos centras (LUDŽ) panaudojo daugybinį virškinamojo trakto patogenų realaus laiko PGR tyrimą, galintį vienu metu aptikti 28 patogenus, įskaitant 8 virusus, 17 bakterijų ir 3 parazitus, kad patikrintų aštuonis klinikinius mėginius. Spalio 17 d. šeši mėginiai buvo teigiami dėl C grupės rotaviruso, sėkmingai identifikuojant sukėlėją.
Siekdami toliau nustatyti protrūkio šaltinį, tyrėjai atliko ir nanoporų metagenominę sekvenavimą, ir „Macro & Micro-Test“ zondo fiksavimo viso genomo praturtinimo sekvenavimą penkiuose teigiamuose mėginiuose. Šiuo metodu sėkmingai buvo sugeneruotos penkios pilnos RVC genomo sekos (SC01–SC05). Integruota greito daugybinio PGR atrankos ir didelės skiriamosios gebos viso genomo sekvenavimo strategija suteikė tvirtą techninę paramą tiksliai molekulinei epidemiologijai ir šaltinio atsekimui.
Mokslinės įžvalgos: pirmasis M2 genotipo identifikavimas Pietvakarių Kinijoje
Remdamasi aukštos kokybės viso genomo duomenimis, gautais naudojant „Macro & Micro-Test“ technologiją, tyrėjų komanda paskelbė keletą svarbių mokslinių išvadų:
Monokloninio protrūkio patvirtinimas:Visi penki virusiniai izolatai turėjo identišką viso genomo genotipą (G4-P[2]-I2-R2-C2-M2-A2-N2-T2-E2-H2), o vieno nukleotido polimorfizmas (SNP) skyrėsi tik nuo 0 iki 1, o tai galutinai įrodo, kad protrūkis kilo iš vienos perdavimo grandinės.
M2 genotipo atradimas:Filogenetinė analizė parodė, kad Luzhou RVC padermės priklausė M2 genotipui, o ne M3 genotipui, kuris anksčiau buvo laikomas vyraujančiu tarp Kinijos RVC padermių. Šis atradimas meta iššūkį įprastam RVC genotipo paplitimo Kinijoje supratimui ir patvirtina M2 genotipo atsiradimą pietvakarių Kinijoje.
Tarptautinių perdavimo ryšių įrodymai:Viso genomo palyginimas parodė didelį genetinį panašumą tarp Luzhou padermių ir RVC padermių, apie kurias anksčiau buvo pranešta Junane (2025 m.), Novosibirske (Rusija) (2017 m.) ir Italijoje (2012 m.), o tai rodo aktyvaus Eurazijos perdavimo tinklo egzistavimą.
Prevencijos ir kontrolės pasekmės: ankstyvas nustatymas ir greita intervencija yra būtini
Nustačius patogeną, Ludžou Ligų kontrolės ir prevencijos centras (CDC) nedelsdamas įgyvendino išsamias kontrolės priemones, įskaitant atvejų izoliavimą, aplinkos dezinfekciją, standartizuotą vėmimo valdymą ir laikiną klasės sustabdymą. Protrūkis buvo sėkmingai suvaldytas per vieną inkubacinį laikotarpį, po spalio 21 d. daugiau atvejų nepranešta.
Tyrimas taip pat pateikia svarbią visuomenės sveikatos pamoką: klasterinių gastroenterito protrūkių, kurių metu tiek A grupės rotaviruso, tiek noroviruso tyrimai yra neigiami, atveju C grupės rotavirusas ir kiti ne A grupės rotavirusai turėtų būti įtraukti į įprastinę diagnostinę patikrą.
Šis tyrimas yra pirmasis praneštas C grupės rotaviruso protrūkis pietvakarių Kinijoje ir pirmasis M2 genotipo identifikavimas regione, praplečiantis dabartinį RVC epidemiologijos supratimą Rytų Azijoje. Šiame tyrime „Macro & Micro-Test“ integruotas sprendimas, derinantis daugybinę PGR patikrą su viso genomo praturtinimo sekvenavimu, parodė didelę praktinę vertę, nes leido greitai identifikuoti patogenus ir sekti didelės skiriamosios gebos molekulinį šaltinį, suteikdamas atkartojamą techninę sistemą tiksliam būsimų infekcinių ligų protrūkių tyrimui ir kontrolei.
Įrašo laikas: 2026 m. liepos 30 d.