Šešių rūšių kvėpavimo takų patogenai
Produkto pavadinimas
HWTS-OT058A/B/C/Z – realaus laiko fluorescencinis RT-PGR rinkinys šešių rūšių kvėpavimo takų patogenams aptikti
sertifikatas
CE
Epidemiologija
2019 m. koronaviruso liga, vadinama „COVID-19“, reiškia SARS-CoV-2 infekcijos sukeltą plaučių uždegimą. SARS-CoV-2 yra β genties koronavirusas. COVID-19 yra ūminė kvėpavimo takų infekcinė liga, kuriai populiacija yra jautri. Šiuo metu infekcijos šaltinis daugiausia yra SARS-CoV-2 užsikrėtę pacientai, taip pat gali užsikrėsti ir besimptomiai užsikrėtę asmenys. Remiantis dabartiniais epidemiologiniais tyrimais, inkubacinis laikotarpis yra 1–14 dienų, dažniausiai 3–7 dienos. Pagrindinės ligos apraiškos yra karščiavimas, sausas kosulys ir nuovargis. Keliems pacientams pasireiškė nosies užgulimas, sloga, gerklės skausmas, mialgija ir viduriavimas.
Gripas, paprastai vadinamas „flu“, yra ūminė kvėpavimo takų infekcinė liga, kurią sukelia gripo virusas. Ji yra labai užkrečiama. Ji daugiausia perduodama kosint ir čiaudint. Paprastai protrūkiai pasireiškia pavasarį ir žiemą. Gripo virusai skirstomi į gripo A, IFV A, gripo B, IFV B ir gripo C, IFV C tris tipus, visi priklauso lipniesiems virusams, sukelia žmonėms ligas daugiausia dėl gripo A ir B virusų, tai vienos grandinės, segmentuotos RNR virusas. Gripo A virusas yra ūminė kvėpavimo takų infekcija, įskaitant H1N1, H3N2 ir kitus potipius, kurie yra linkę mutuoti ir protrūkiai visame pasaulyje. „Poslinkis“ reiškia gripo A viruso mutaciją, dėl kurios atsiranda naujas viruso „potipis“. Gripo B virusai skirstomi į dvi linijas: Yamagata ir Victoria. Gripo B virusas turi tik antigeninį dreifą ir dėl mutacijos išvengia žmogaus imuninės sistemos stebėjimo ir eliminavimo. Tačiau gripo B viruso evoliucijos greitis yra lėtesnis nei žmogaus gripo A viruso. Gripo B virusas taip pat gali sukelti žmonių kvėpavimo takų infekcijas ir epidemijas.
Adenovirusas (AdV) priklauso žinduolių adenovirusams – dvigrandžiams DNR virusams be apvalkalo. Rasta mažiausiai 90 genotipų, kuriuos galima suskirstyti į AG 7 pogenčius. AdV infekcija gali sukelti įvairių ligų, įskaitant pneumoniją, bronchitą, cistitą, akių konjunktyvitą, virškinimo trakto ligas ir encefalitą. Adenovirusinė pneumonija yra viena iš sunkesnių bendruomenėje įgytos pneumonijos rūšių vaikams, sudaranti apie 4–10 % visų bendruomenėje įgytos pneumonijos atvejų.
Mycoplasma pneumoniae (MP) yra mažiausi prokariotiniai mikroorganizmai, esantys tarp bakterijų ir virusų, turintys ląstelės struktūrą, bet neturintys ląstelės sienelės. MP daugiausia sukelia žmonių kvėpavimo takų infekcijas, ypač vaikams ir jaunimui. Ji gali sukelti žmonių mikoplazminę pneumoniją, vaikų kvėpavimo takų infekciją ir netipinę pneumoniją. Klinikiniai požymiai yra įvairūs, dažniausiai stiprus kosulys, karščiavimas, šaltkrėtis, galvos skausmas, gerklės skausmas. Dažniausiai pasireiškia viršutinių kvėpavimo takų infekcija ir bronchų pneumonija. Kai kuriems pacientams viršutinių kvėpavimo takų infekcija gali išsivystyti į sunkią pneumoniją, gali ištikti sunkus kvėpavimo sutrikimas ir mirtis.
Kvėpavimo sincitinis virusas (RSV) yra RNR virusas, priklausantis paramiksoviridae šeimai. Jis perduodamas oro lašeliniu būdu ir artimo kontakto būdu ir yra pagrindinis apatinių kvėpavimo takų infekcijos sukėlėjas kūdikiams. Kūdikiams, užsikrėtusiems RSV, gali išsivystyti sunkus bronchiolitas (vadinamas bronchiolitu) ir pneumonija, kurie yra susiję su vaikų astma. Kūdikiams pasireiškia sunkūs simptomai, įskaitant aukštą karščiavimą, rinitą, faringitą ir laringitą, o vėliau bronchiolitą ir pneumoniją. Kai kuriems sergantiems vaikams gali pasireikšti vidurinės ausies uždegimas, pleuritas, miokarditas ir kt. Viršutinių kvėpavimo takų infekcija yra pagrindinis infekcijos simptomas suaugusiesiems ir vyresniems vaikams.
Kanalas
Kanalo pavadinimas | R6 reakcijos buferis A | R6 reakcijos buferis B |
Šeimos narių skaičius | SARS-CoV-2 | HAdV |
VIC/HEX | Vidaus kontrolė | Vidaus kontrolė |
CY5 | IFV A | MP |
ROX | IFV B | RSV |
Techniniai parametrai
Sandėliavimas | Skystis: ≤-18 ℃ tamsoje; Liofilizuotas: ≤30 ℃ tamsoje |
Galiojimo laikas | Skystas: 9 mėnesiai; liofilizuotas: 12 mėnesių |
Mėginio tipas | Visas kraujas, plazma, serumas |
Ct | ≤38 |
CV | ≤5,0% |
LoD | 300 kopijų/ml |
Specifiškumas | Kryžminio reaktyvumo rezultatai parodė, kad tarp rinkinio ir žmogaus koronaviruso SARSr-CoV, MERSr-CoV, HCoV-OC43, HCoV-229E, HCoV-HKU1, HCoV-NL63, 1, 2, 3 tipo paragripo viruso, rinoviruso A, B, C, chlamidijos pneumonijos viruso, žmogaus metapneumoviruso, enteroviruso A, B, C, D, žmogaus plaučių viruso, Epšteino-Baro viruso, tymų viruso, žmogaus citomegaloviruso, rotaviruso, noroviruso, kiaulytės viruso, vėjaraupių-juostinės pūslelinės viruso, legionelių, bordetella pertussis, Haemophilus influenzae, staphylococcus aureus, streptococcus pneumoniae, S. pyogenes, klebsiella pneumoniae, mycobacterium tuberculosis, dūmų aspergillus, Candida albicans, Candida glabrata, pneumocystis jiroveci ir naujagimių kriptokoko bei žmogaus genominės nukleorūgšties kryžminės reakcijos nebuvo. |
Taikomi instrumentai | Jis gali prilygti pagrindiniams rinkoje esantiems fluorescenciniams PGR instrumentamsSLAN-96P realaus laiko PGR sistemos ABI 7500 realaus laiko PGR sistemos ABI 7500 greitos realaus laiko PGR sistemos QuantStudio®5 realaus laiko PGR sistemos Šviesos ciklas®480 realaus laiko PGR sistemų „LineGene 9600 Plus“ realaus laiko PGR aptikimo sistemos MA-6000 realaus laiko kiekybinis terminis cikleris „BioRad CFX96“ realaus laiko PGR sistema, „BioRad“ CFX Opus 96 realaus laiko PGR sistema |