Žmogaus EGFR geno 29 mutacijų aptikimo rinkinys (fluorescencinė PGR) – RUO
Produkto pavadinimas
Žmogaus EGFR geno 29 mutacijų aptikimo rinkinys (fluorescencinė PGR) – RUO
Epidemiologija
Plaučių vėžys tapo pagrindine mirčių nuo vėžio priežastimi visame pasaulyje, keliančia rimtą grėsmę žmonių sveikatai. Nesmulkialąstelinis plaučių vėžys sudaro apie 80–85 % plaučių vėžiu sergančių pacientų. Šiuo metu EGFR yra svarbiausias molekulinis taikinys gydant nesmulkialąstelinį plaučių vėžį. EGFR fosforilinimas gali skatinti naviko ląstelių augimą, diferenciaciją, invaziją, metastazes, slopinti apoptozę ir skatinti naviko angiogenezę. EGFR tirozino kinazės inhibitoriai (TKI) gali blokuoti EGFR signalizacijos kelią slopindami EGFR autofosforilinimą, tokiu būdu slopindami naviko ląstelių proliferaciją ir diferenciaciją, skatindami naviko ląstelių apoptozę, mažindami naviko angiogenezę ir kt., taip pasiekdami į naviką nukreiptą terapiją [1]. Daugybė tyrimų parodė, kad EGFR-TKI terapinis veiksmingumas yra glaudžiai susijęs su EGFR geno mutacijos būsena ir gali specifiškai slopinti naviko ląstelių, turinčių EGFR geno mutaciją, augimą [2, 3]. EGFR genas yra 7 chromosomos trumpojoje rankoje (7p12), jo visas ilgis yra 200 Kb ir jį sudaro 28 egzonai. Mutacijos regionas daugiausia yra 18–21 egzonuose, 746–753 kodonuose esanti delecijos mutacija 19 egzone sudaro apie 45 %, o L858R mutacija 21 egzone – apie 40–45 % [4]. NCCN nesmulkialąstelinio plaučių vėžio diagnostikos ir gydymo gairėse aiškiai nurodoma, kad prieš skiriant EGFR-TKI, reikia atlikti EGFR geno mutacijų tyrimą. Šis tyrimų rinkinys naudojamas epidermio augimo faktoriaus receptoriaus tirozino kinazės inhibitoriaus (EGFR-TKI) vaistų skyrimui vadovauti ir yra personalizuotos medicinos pagrindas pacientams, sergantiems nesmulkialąsteliniu plaučių vėžiu. Šis rinkinys naudojamas tik dažnoms EGFR geno mutacijoms nustatyti pacientams, sergantiems nesmulkialąsteliniu plaučių vėžiu. Tyrimo rezultatai yra tik klinikinės informacinės paskirties ir neturėtų būti naudojami kaip vienintelis individualizuoto pacientų gydymo pagrindas. Gydytojai turėtų atsižvelgti į paciento būklę, vaistų indikacijas ir gydymą. Reakcija ir kiti laboratorinių tyrimų rodikliai bei kiti veiksniai naudojami siekiant visapusiškai įvertinti tyrimo rezultatus.
Kanalas
| Reakcijos buferis | Kanalas |
| EGFR IC reakcijos buferis | Šeimos narių kanalas |
| L858R reakcijos buferis | Šeimos narių kanalas |
| 19del reakcijos buferis | Šeimos narių kanalas |
| T790M reakcijos buferis | Šeimos narių kanalas |
| G719X reakcijos buferis | Šeimos narių kanalas |
| 3Ins20 reakcijos buferis | Šeimos narių kanalas |
| L861Q reakcijos buferis | Šeimos narių kanalas |
| S768I reakcijos buferis | Šeimos narių kanalas |
Techniniai parametrai
| Sandėliavimas | Skystis: ≤ -18 ℃ tamsoje |
| Galiojimo laikas | 12 mėnesių |
| Mėginio tipas | šviežias naviko audinys, užšaldytas patologinis pjūvis, parafinu įlietas patologinis audinys ar pjūvis, plazma ar serumas |
| CV | <5,0% |
| LoD | nukleorūgščių reakcijos tirpalo aptikimas esant 3 ng/μL laukinio tipo fonui, gali stabiliai aptikti 1% mutacijos dažnį; b) nukleorūgščių reakcija. Esant 1 % mutacijos dažniui, 1 × 103 kopijų/ml mutaciją galima stabiliai aptikti laukinio tipo fone, kai mutacijos dažnis yra 1 × 105 kopijų/ml; c) Vidinis etaloninis reakcijos tirpalas gali aptikti etaloninį produktą SW3, kurio aptikimo riba yra žemiausia, palyginti su įmonės vidine etalonine medžiaga. Kai rinkinys aptinka nacionalinę aptikimo ribos etaloninę medžiagą, galima stabiliai aptikti 2,5 % mutacijų dažnio aptikimo ribos etaloninę medžiagą ir EGFR geno amplifikacijos mutaciją, kurios kopijų skaičiaus variacija yra 4. |
| Specifiškumas | Nėra kryžminio reaktyvumo su laukinio tipo žmogaus genomine DNR ir kitais mutantų tipais |
| Taikomi instrumentai | „Applied Biosystems 7500“ realaus laiko PGR sistemos, „Applied Biosystems 7300“ realaus laiko PGR sistemos, „QuantStudio® 5“ realaus laiko PGR sistemos, „LightCycler® 480“ realaus laiko PGR sistema, „BioRad CFX96“ realaus laiko PGR sistema. |
Darbo srautas
Reikalingi, bet nepateikti reagentai:Vanduo be DNazės/RNazės, bevandenis etanolis. Tiriant parafinu įterptą audinio mėginį, rekomenduojama naudoti „QIAGEN“ „QIAamp DNA FFPE Tissue Kit“ (56404) ir „Tiangen Biotech (Beijing) Co., Ltd.“ parafinu įterptą audinių DNR greito ekstrakcijos rinkinį (DP330). Tiriant plazmos/serumo mėginį, rekomenduojama naudoti „Macro & Micro-Test General DNA/RNA Kit“ (HWTS-3019-50, HWTS-3019-32, HWTS-3019-48, HWTS-3019-96) (kurį galima naudoti su „Macro & Micro-Test“ automatiniu nukleorūgščių ekstraktoriumi (HWTS-3006C, HWTS-3006B)) „Jiangsu Macro & Micro-Test Med-Tech Co., Ltd.“ arba „QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit“ (55114) „QIAGEN“.
Reikalingos, bet nepateikiamos eksploatacinės medžiagosAntgaliai be DNazės/RNazės, vienkartinės pirštinės, centrifugos mėgintuvėlis be DNazės/RNazės, 8 mėgintuvėlių juostelės PGR, centrifuga.








